DAP-Seq
- 高通量
- 无需抗体
- 灵活可控
- 物种普适性广
服务特色
DAP-seq（DNA亲和纯化测序）技术的核心优势在于其无需体内实验便可高效解析转录因子结合位点。它通过将体外表达的转录因子与基因组DNA文库共孵育，结合高通量测序，直接、全局性地绘制全基因组范围内的蛋白结合图谱。该方法绕过了复杂的转基因操作，尤其适用于研究难以在体内操作的转录因子，具有通量高、周期短、不受内源干扰的显著优势，是挖掘基因调控网络的有力工具。有力工具。
服务介绍
DAP-Seq是一种用于鉴定转录因子结合位点的高通量测序技术，通过体外表达带有亲和标签的转录因子，与基因组DNA文库孵育，使转录因子特异性结合DNA片段，再利用亲和纯化技术捕获结合的DNA，最后通过高通量测序确定转录因子的结合位点。
服务优势
- 无需抗体/转基因：规避物种限制，尤其适合非模式植物。
- 高效低成本：体外表达周期短，通量高。
- 保留表观印记：可使用天然gDNA（含甲基化等修饰）。
- 灵活可控：可人为添加辅因子，模拟特定生理环境。
- 与ChIP-seq对比：DAP-seq适用范围扩展至数百种缺乏遗传工具的植物物种。
服务流程
客户提供
样本量：柔软组织3g-5g；木本科植物的树根、树皮、树枝等10g-20g；
果实、种子10g-20g；花序、花蕊、花粉2g-3g。
样本处理：样本采集时如果植物组织表面污渍较多，应迅速用预冷的RNase-free水或75%乙醇擦拭或冲洗干净，再用吸水纸吸干植物表面残留液体，液氮速冻，-80℃保存，干冰寄送。
最终交付
- 结题报告及原始数据
- 测序数据质量评估，过滤掉质量数据，保证数据质量
- Peak 在 TSS 附近的分布
- Peak 在染色体上的分布 Peak 在基因组功能区的分布
- Peak 相关基因的 Gene Ontology 富集分析
- Peak 相关基因的 KEGG 富集分析
- 富集区间 Motif 分析
服务说明
| 产品 | 测序数据量 | 平台 |
周期（工作日，提取+测序分析） |
备注 |
| DAP-seq | 8G | Illumina |
50 |
每组实验包含两个技术重复和一个input |
案例分析
文献来源：Yang C, et al. GmMYB4 Positively Regulates Isoflavone Biosynthesis via the GmMAPK6-GmMYB4-MBW Module in Soybean. Plant Biotechnol J. 2025 Oct 25.
MYB 转录因子 （TF） 是大豆中异黄酮生物合成的关键调节因子，但其调节功能的确切机制仍知之甚少，通过全基因组关联研究和功能表征确定了 GmMYB4 是异黄酮积累的关键正调节因子。为了阐明 GmMYB4 介导的调控的分子机制，结合 DAP-seq 和 RNA-seq 数据集进行综合分析，确定了1477个基因作为其潜在的直接靶标。KEGG通路富集分析显示这些基因显著富集于类黄酮生物合成通路，包括编码查尔酮合成酶、黄烷酮-羟化酶和黄烷醇合成酶的关键基因。证明了GmMYB是作为控制大豆中类黄酮和原花青素生物合成和积累的关键转录调节因子。
DAP-seq和RNA-seq技术联合对GmMYB4结合位点和靶基因进行全基因组分析
